<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif; ">
<div>
<div>
<div>Hi folks,</div>
<div><br>
</div>
<div>I'm back to trying to upgrade eagle-I, and I'm receiving the same kind of output as before when running the data migration script. &nbsp;See attached. &nbsp;The script claims to have run successfully, but shows command usage info as if underlying commands were not
 called correctly. &nbsp;Nothing was written to any of the logs.</div>
<div><br>
</div>
<div>I'm doing this with the repository and data migrations tools from 2.0-MS2.16 this time. &nbsp;I made certain there were no old instances of the&nbsp;eagle-i-datatools-datamanagement.jar before downloading the jar for the newest release.</div>
<div><br>
</div>
<div>Any thoughts or suggestions?</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div><br>
</div>
<div>-Dave</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div style="font-family: Calibri; font-size: medium; ">
<div class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; ">
<span style="font-size: 18pt; color: rgb(31, 73, 125); ">
<hr size="1" width="35%" noshade="" align="left" style="color: rgb(31, 35, 62); ">
</span></div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; "><span style="font-size: 18pt; color: rgb(31, 35, 62); ">David Tolmie</span><span style="font-size: 18pt; color: rgb(31, 35, 62); "><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; "><b><span style="font-size: 14pt; color: rgb(198, 159, 48); ">Systems Librarian</span></b><b><span style="color: rgb(198, 159, 48); ">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</span></b><b><span style="font-size: 14pt; color: rgb(198, 159, 48); "><o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; "><b><span style="font-size: 10pt; color: rgb(106, 145, 144); ">Arnold Library | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Seattle, WA<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; "><b><span style="font-size: 10pt; color: rgb(106, 145, 144); "><a href="mailto:dtolmie@fhcrc.org" style="color: purple; "><span style="color: rgb(106, 145, 144); ">dtolmie@fhcrc.org</span></a>&nbsp;
 |&nbsp; tel 206.667.6852 |&nbsp; fax 206.667.4737</span></b><b><span style="color: rgb(138, 169, 169); "><o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; "><a href="http://library.fhcrc.org/" style="color: purple; "><span style="color: blue; text-decoration: none; "><img border="0" width="234" height="51" id="Picture_x0020_1" src="cid:99BDE5AD-7270-4D35-A031-FFDD39303A9D" alt="Description: Description: Description: Description: AL-Logo-color" type="image/png"></span></a><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; "><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
</div>
</div>
<div><br>
</div>
<span id="OLK_SRC_BODY_SECTION">
<div style="font-family:Calibri; font-size:11pt; text-align:left; color:black; BORDER-BOTTOM: medium none; BORDER-LEFT: medium none; PADDING-BOTTOM: 0in; PADDING-LEFT: 0in; PADDING-RIGHT: 0in; BORDER-TOP: #b5c4df 1pt solid; BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-TOP: 3pt">
<span style="font-weight:bold">From: </span>&lt;Cheng&gt;, &quot;Cheng, Sophia&quot; &lt;<a href="mailto:Sophia_Cheng@hms.harvard.edu">Sophia_Cheng@hms.harvard.edu</a>&gt;<br>
<span style="font-weight:bold">Reply-To: </span>&quot;<a href="mailto:eagle-i-admins@open.med.harvard.edu">eagle-i-admins@open.med.harvard.edu</a>&quot; &lt;<a href="mailto:eagle-i-admins@open.med.harvard.edu">eagle-i-admins@open.med.harvard.edu</a>&gt;<br>
<span style="font-weight:bold">Date: </span>Tuesday, July 23, 2013 4:51 PM<br>
<span style="font-weight:bold">To: </span>David Tolmie &lt;<a href="mailto:dtolmie@fhcrc.org">dtolmie@fhcrc.org</a>&gt;, &quot;<a href="mailto:ross.davis@Vanderbilt.Edu">ross.davis@Vanderbilt.Edu</a>&quot; &lt;<a href="mailto:ross.davis@Vanderbilt.Edu">ross.davis@Vanderbilt.Edu</a>&gt;,
 &quot;<a href="mailto:angel@itmat.upenn.edu">angel@itmat.upenn.edu</a>&quot; &lt;<a href="mailto:angel@itmat.upenn.edu">angel@itmat.upenn.edu</a>&gt;, &quot;<a href="mailto:fcoldren@mail.med.upenn.edu">fcoldren@mail.med.upenn.edu</a>&quot; &lt;<a href="mailto:fcoldren@mail.med.upenn.edu">fcoldren@mail.med.upenn.edu</a>&gt;,
 &quot;<a href="mailto:sukie@dartmouth.edu">sukie@dartmouth.edu</a>&quot; &lt;<a href="mailto:sukie@dartmouth.edu">sukie@dartmouth.edu</a>&gt;<br>
<span style="font-weight:bold">Cc: </span>&quot;Ciriello, Marc&quot; &lt;<a href="mailto:Marc_Ciriello@hms.harvard.edu">Marc_Ciriello@hms.harvard.edu</a>&gt;, &quot;Bourges, Daniela&quot; &lt;<a href="mailto:Daniela_Bourges@hms.harvard.edu">Daniela_Bourges@hms.harvard.edu</a>&gt;, &quot;Cole,
 Julian C&quot; &lt;<a href="mailto:Julian_Cole@hms.harvard.edu">Julian_Cole@hms.harvard.edu</a>&gt;, &quot;Neiman, David&quot; &lt;<a href="mailto:David_Neiman@hms.harvard.edu">David_Neiman@hms.harvard.edu</a>&gt;, &quot;<a href="mailto:eagle-i-admins@open.med.harvard.edu">eagle-i-admins@open.med.harvard.edu</a>&quot;
 &lt;<a href="mailto:eagle-i-admins@open.med.harvard.edu">eagle-i-admins@open.med.harvard.edu</a>&gt;<br>
<span style="font-weight:bold">Subject: </span>New process and data migration issues &amp; clarification of properties [2.0-MS2.14]<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-family: Consolas, monospace; font-size: 12px; ">
Now, regarding some of the issues that have been encountered:</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-family: Consolas, monospace; font-size: 12px; ">
(1) Some of you have reported having issues running the data-migration.sh for the latest release, 2.0-MS2.14.&nbsp;&nbsp;This issue manifests with notification of incorrect/missing parameters during the execution of the script, but the script does not fail.&nbsp;&nbsp;The output
 looks similar to the attached file.&nbsp;&nbsp;I have been unable to reproduce the error using the files that were mentioned in the initial email:</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-family: Consolas, monospace; font-size: 12px; ">
<div>Datamangement Toolkit - &nbsp;<a href="http://infra.search.eagle-i.net:8081/nexus/content/repositories/releases/org/eagle-i/eagle-i-datatools-datamanagement/">http://infra.search.eagle-i.net:8081/nexus/content/repositories/releases/org/eagle-i/eagle-i-datatools-datamanagement/</a>&nbsp;</div>
<div>Repository - &nbsp;<a href="http://infra.search.eagle-i.net:8081/nexus/content/repositories/releases/org/eagle-i/eagle-i-repository-dist/">http://infra.search.eagle-i.net:8081/nexus/content/repositories/releases/org/eagle-i/eagle-i-repository-dist/</a>&nbsp;</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-family: Consolas, monospace; font-size: 12px; ">
Not everyone has run into this problem, so I'm wondering if I could ask those of you who have had problems to remove your existing eagle-i-datatools-datamanagement.jar, re-download the jar and try the script again.</div>
</span>
</body>
</html>